合水口站位于光明区合水路与碧水路之间的松白路上,沿松白路路中呈东西向敷设。西接薯田埔站,东接公明广场站。站厅B端设置公共卫生间(含残疾人卫生间),车站站厅设1个客服中心,站台为岛式站台。合水口站为地面三层高架站,共设出入口4个:A口、B口、C口、D口。其中,A口位于松白路东北侧,为科学馆方向公交接驳口;B口位于松白路西北侧,为主要紧急出入口;C口位于松白路辅路西南侧,为备用紧急出入口;D口位于松白路辅路东南侧,为松岗方向公交接驳口。