骨干道路规划建设由主干道组成的内环通道及高快速路组成的外环通道，重点建设狮子洋通道等过江通道，加密湾区东西岸联系，形成“六横七纵”的高快速路网。航空发展规划预留了南沙通用机场及其周边交通体系。
港口发展规划建设以南沙作业区为主，沙仔岛作业区为辅，小虎及芦湾作业区互为功能补充的客货兼顾的现代化综合性国际门户枢纽港。
枢纽方面
规划建设“3主3辅多节点”客运枢纽体系
3主：南沙站、庆盛站、邮轮母港枢纽；
3辅：横沥站、南沙客运站、通用机场；
多节点：黄阁站、蕉门站、大涌东站、大岗站、榄核站、十六涌站等。
规划打造“1特2主1辅多节点”交通物流枢纽
1特：南沙港国际航运枢纽；
2主：万顷沙物流基地、大岗货运站；
1辅：小虎岛物流中心；
多节点：沙仔岛、黄阁、裕丰、榄核、东涌物流中心等。
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